Además de ENESA, intervienen de manera importante en la aplicación y desarrollo del sistema, otros organismos y entidades que tienen asignadas tareas específicas en dicha labor:
La Direccción General de Seguros y Fondo de Pensiones
Esta Dirección General, del Ministerio de Economía y Empresa, tiene encomendadas las tareas de control de la actividad aseguradora, al igual que en el resto de ramos. Entre estas tareas se incluye, por tanto, el control de las condiciones especiales y tarifas de aplicación por las entidades aseguradoras. Igualmente le corresponde aprobar el porcentaje de distribución del coaseguro entre las entidades incluidas en Agroseguro y, conjuntamente con ENESA, establecer los porcentajes de subvención al coste del seguro y las normas de tasación.
El Consorcio de Compensación de Seguros
Esta sociedad estatal sujeta en su actividad al ordenamiento jurídico privado, actúa como reasegurador obligatorio del sistema y tiene encomendado el control de las peritaciones y la asunción del porcentaje de coaseguro no cubierto por las entidades aseguradoras.
Las Comunidades Autónomas
Las Comunidades Autónomas participan igualmente en el desarrollo del Sistema de Seguros Agrarios a través de las Comisiones Territoriales, cuya presidencia ostentan, y su pertenencia a la Comisión General de ENESA y a la Comisión de Coordinación con las Comunidades Autónomas. Su participación se concreta así mismo concediendo subvenciones al coste del seguro a los agricultores y ganaderos, de manera complementaria a las concedidas por ENESA.
La Agrupación Española de Entidades Aseguradoras de los Seguros Agrarios Combinados, S.A. (AGROSEGURO)
Es una sociedad participada por las distintas entidades aseguradoras que operan en el sistema, las cuales se constituyen en sistema de coaseguro para gestionar los riesgos del sistema. Esta sociedad, en nombre y por cuenta de las entidades que la integran, realiza la gestión general del sistema, elabora las condiciones y tarifas que serán de aplicación, controla la contratación de pólizas que realizan las redes comerciales de las entidades aseguradoras, cobra las primas abonadas por los asegurados, gestiona la subvención correspondiente a los asegurados, realiza la valoración de los daños ocasionados por los siniestros y procede al pago de las indemnizaciones que procedan.
Las Organizaciones Profesionales Agrarias y Cooperativas Agrarias
Estas Organizaciones participan activamente en el desarrollo y aplicación del sistema en representación de los agricultores y ganaderos, que son los destinatarios finales del mismo. Dado el carácter voluntario del seguro, el agricultor y ganadero tiene asignado el papel protagonista en la tarea de garantizar la estabilidad de sus propias rentas. Estas Organizaciones forman parte de la Comisión General de ENESA e intervienen en todos los Grupos de Trabajo que se celebran en la misma para definir las condiciones de aseguramiento. Así mismo intervienen como tomadores de pólizas colectivas e incluso participan como aseguradores a través de las mutuas existentes.